Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa11P50709 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms