Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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