Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtpreP49446 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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