Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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