Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms