Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TtlP38585 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TtlP38585 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtlP38585 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms