Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Saa4P31532 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms