Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc11P31313 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc11P31313 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc11P31313 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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