Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RxraP28700 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RxraP28700 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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