Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxd10P28359 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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