Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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