Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms