Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms