Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms