Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms