Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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