Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Cxcl1P12850 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Cxcl1P12850 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cxcl1P12850 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cxcl1P12850 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cxcl1P12850 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cxcl1P12850 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cxcl1P12850 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl1P12850 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl1P12850 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl1P12850 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl1P12850 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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