Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms