Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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UbbP0CG49 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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