Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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H2-Ab1P01921 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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H2-Ab1P01921 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Ab1P01921 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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