Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01725 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01725 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01725 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms