Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01666 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01666 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01666 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms