Protein–RNA interactions for Protein: O88822

Sc5d, Lathosterol oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sc5dO88822 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sc5dO88822 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms