Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp4O70480 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms