Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms