Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms