Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Slc18a3O35304 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms