Protein–RNA interactions for Protein: L7N476

Gm9611, Predicted gene 9611 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9611L7N476 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm9611L7N476 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9611L7N476 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms