Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms