Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms