Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms