Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5294J3QP53 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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