Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm3727J3QM54 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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