Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms