Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms