Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Srp72F8VQC1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srp72F8VQC1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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