Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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