Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms