Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm340F6RGI3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm340F6RGI3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm340F6RGI3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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