Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms