Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Triml2E9PW10 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms