Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms