Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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