Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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