Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf39A2RT81 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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