Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms