Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upf2A2AT37 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms