Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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