Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms