Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Krtap1-3A2A588 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Krtap1-3A2A588 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms